La costruzione del Monastero di San Colombano incominciò nel 613 intorno al primo nucleo della basilica di San Pietro. ?La Basilica nonostante la semplicità degli elementi decorativi ha una struttura grandiosa che esprime l’architettura di transizione tra il periodo gotico e il rinascimento. La composizione pittorica della navata centrale è opera di Bernardino Lanzani e databile al 1526-30.
Due rampe di scale situate ai lati della cappella maggiore permettono l’accesso alla cripta. Qui dietro un’inferriata è visibile un pregevole mosaico della prima metà del XII secolo .
Entrando nella cripta sulla destra troviamo una bella cancellata in ferro che in origine racchiudeva il coro monastico per impedire che la preghiera dei monaci fosse disturbata da occhi profani. Al centro della cripta è custodito il sarcofago di San Colombano e sulle pareti a lato due transenne longobarde usate per i sepolcri di san Attala e san Bertulfo ,rispettivamente secondo e terzo abate di Bobbio.